教学部负责临床医学院(五年制、5+3一体化、儿科专业)、口腔医学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、留学生全英教学等理论教学与实践教学的管理工作;负责组织教材与课程建设、教学改革研究、教学成果的申报与管理工作及师资培养。旗下临床技能中心承担本科生实践教学及硕士生、博士生、全院住院医师、青年医生及护理人员的技能培训和考核,是吉林大第一医院重要的实践教学和临床技能培训基地。